Nie mamy niestety możliwości dowolnego ustawienia kolejności efektów w łańcuchu sygnału – co oferował Line 6 HD500 – ale możemy określić, czy dany efekt będzie „wpięty” przed czy po sekcji preampu. Wersja Line 6 POD HD400 posiada ten sam zasób efektów co najwyższy model serii, natomiast Line 6 POD HD300 ma ich trochę mniej (szczegółowe zestawienie w tabeli obok). Różnica ta jednak nie jest na tyle znaczna, żeby odczuwać z jej powodu jakieś braki. To tak jak mieć lub nie mieć w samochodzie elektrycznie ustawiane lusterka czy czujnik cofania – miło by było, ale bez tego też pojedziemy i to wcale nie gorzej.